HomeBrew 与无 root 权限 Linux 环境包管理

一些公用的 Linux 服务器，处于维护以及安全考虑，一般只会提供普通权限用户给使用者。
普通用户的权限满足日常使用是够了，但是难以配置自己的开发环境，安装一些自己需要的包。

如果都从源码编译安装软件，依赖的维护过于复杂，初始编译工具链的版本可能也不满足需求，如 gcc 版本过低。
如果申请 sudo 权限或者请求更新系统或安装 docker，后期责任难以界定，运维和管理员一般也不会同意。

所以，最优方案还是有需求的用户在个人目录维护自己的工具链和环境。下文方案为围绕 HomeBrew 构建。

安装 miniconda 解决前置依赖

如果你的系统比较新，可以直接尝试安装 HomeBrew。

基于上面讨论的内容，公用服务器一般存在系统版本低的问题，是 centos7 或者 centos6 也毫不稀奇，而且如 glibc 等库的版本也非常低。

安装 HomeBrew 有两个强依赖，git 及 curl，而且依赖的版本都比较高，centos7 的版本也不能满足。
另外，由于 Brew 不少软件都需要从源码编译，gcc 和良好的网络环境也不可缺少。

幸好 miniconda 能够解决以上几点问题。miniconda 只是提供 HomeBrew 安装的依赖，后续可以删除。

配置 conda 源（可选）：新建 .condarc，包含以下内容

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

下载及安装 miniconda

# 下载
# 如果服务器的内置证书已过期， 增加 --no-check-certificate 条件跳过证书验证
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh && chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

# 安装
./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -p ~/miniconda3
source ~/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh

# 安装所需包
conda install -y gcc_linux-64 gxx_linux-64 curl git

# 链接 gcc，等 HomeBrew 安装完成这些链接可以删掉
cd ~/miniconda3/bin/
ln -s x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc gcc
ln -s x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cpp c++
ln -s gcc cc

配置安装环境变量

这些环境变量也可以配置到 bashrc 等文件，使之永久生效

# 设置 curl 和 git，可选
export HOMEBREW_CURL_PATH=~/miniconda3/bin/curl
export HOMEBREW_GIT_PATH=~/miniconda3/bin/git

# 设置安装源为清华源，如果网络畅通可忽略，清华源也可能403
export HOMEBREW_INSTALL_FROM_API=1
export HOMEBREW_API_DOMAIN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/homebrew-bottles/api"
export HOMEBREW_BOTTLE_DOMAIN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/homebrew-bottles"
export HOMEBREW_BREW_GIT_REMOTE="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/git/homebrew/brew.git"
export HOMEBREW_CORE_GIT_REMOTE="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/git/homebrew/homebrew-core.git"

安装 HomeBrew

由于没有 root 权限，HomeBrew 需要手动安装。
由于是手动安装，位置与默认安装位置不同，很多预编译的包就不能用了，都得从源码编译，所以网络和机器性能以及耐心很重要。

# 下载，也可使用清华源 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/git/homebrew/brew.git
git clone https://github.com/Homebrew/brew ~/.homebrew

# 安装
eval "$(~/.homebrew/bin/brew shellenv)"
brew update --force --quiet
chmod -R go-w "$(brew --prefix)/share/zsh"

# 自动加载 brew
echo 'eval "$(~/.homebrew/bin/brew shellenv)"' >> ~/.bashrc

安装 miniconda 解决前置依赖

配置安装环境变量

安装 HomeBrew

参考